自新一代测序技术高速发展以来，作物育种研究产生了海量多种类型的数据，整合和最大化利用这些生物学数据，无疑对现代育种研究具有不可估量的重要意义。然而，在农作物育种研究中，由于采集数据手段以及工具的局限性，往往不能得到完全精准的数据，这对于育种研究带来很多的干扰因素，很显然得到的是不完备的数据。此外，农作物育种是一项复杂的系统工程，涉及种质资源鉴定与创新、新基因发掘、育种技术、品种培育、种子生产及其产业化等，并且所获得的育种数据不局限于单一的田间性状调查结果，同时还存在土壤、气候、水分等动态环境，影响数据、基因表达及分子标记等基因型数据，代谢物动态数据以及生产管理数据，所以本研究针对西北农林科技大学相关团队玉米育种研究数据特点，构造两类模糊覆盖粗糙决策粗糙模型，进行数据实验，对比实际育种结果，分析这两类不完备决策系统处理方法，为高效化、精准化、智能化育种提供理论基础和技术支撑。