基因序列的比对、挖掘和功能分析是计算生物学中最基础的科学问题。本次报告围绕这三个方面介绍报告人近年来的部分成果。在序列比对方面，介绍一种基于后缀树和并行加速的多序列比对和进化树构建算法；在基因挖掘方面，介绍本人近年来在microRNA识别方面的部分工作，主要贡献在于探索高质量反例数据和设计全新的集成分类器；在基因功能分析方面，分别介绍基因-疾病关联分析和基因-作物产量关联分析等工作。